Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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