Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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NFIAQ12857 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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NFIAQ12857 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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NFIAQ12857 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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NFIAQ12857 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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NFIAQ12857 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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NFIAQ12857 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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