Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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GTF3C1Q12789 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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GTF3C1Q12789 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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GTF3C1Q12789 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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