Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CPSF1Q10570 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
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