Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms