Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERVV-2B6SEH9 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERVV-2B6SEH9 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERVV-2B6SEH9 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERVV-2B6SEH9 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERVV-2B6SEH9 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERVV-2B6SEH9 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERVV-2B6SEH9 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERVV-2B6SEH9 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERVV-2B6SEH9 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms