Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r10W4VSP8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r10W4VSP8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms