Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ5

Ramp1, Receptor activity-modifying protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp1Q9WTJ5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ramp1Q9WTJ5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms