Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bcl11aQ9QYE3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bcl11aQ9QYE3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms