Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Batf3Q9D275 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms