Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms