Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ist1Q9CX00 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms