Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RpainQ9CWY9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RpainQ9CWY9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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