Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEO1Q92859 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEO1Q92859 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms