Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med28Q920D3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms