Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hoxc12Q8K5B8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hoxc12Q8K5B8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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