Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms