Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms