Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2Q78Y63 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl2Q78Y63 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms