Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SpopQ6ZWS8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms