Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms