Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms