Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms