Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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