Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LyarQ08288 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LyarQ08288 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LyarQ08288 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms