Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms