Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms