Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms