Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp3P63024 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms