Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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