Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc2P43407 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdc2P43407 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms