Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa10P31310 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa10P31310 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms