Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms