Protein–RNA interactions for Protein: O55192

Slc6a2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a2O55192 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a2O55192 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc6a2O55192 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc6a2O55192 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc6a2O55192 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc6a2O55192 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a2O55192 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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