Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matn3O35701 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matn3O35701 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matn3O35701 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matn3O35701 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matn3O35701 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Matn3O35701 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Matn3O35701 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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