Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms