Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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