Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms