Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62clA2AG10 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62clA2AG10 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms