Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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SH3BP4Q9P0V3 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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