Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LHX9Q9NQ69 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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