Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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