Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 498.4 ms