Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
USP53Q70EK8 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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USP53Q70EK8 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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USP53Q70EK8 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP53Q70EK8 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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USP53Q70EK8 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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USP53Q70EK8 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP53Q70EK8 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP53Q70EK8 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP53Q70EK8 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP53Q70EK8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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USP53Q70EK8 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP53Q70EK8 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP53Q70EK8 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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USP53Q70EK8 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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USP53Q70EK8 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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USP53Q70EK8 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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USP53Q70EK8 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
USP53Q70EK8 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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