Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED9Q6R2W3 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms