Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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