Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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