Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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