Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms