Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK4Q16099 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms