Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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